Bei seiner Ankunft im KZ Buchenwald trägt der Pole Jankowski einen Koffer bei sich, den er wie seinen Augapfel hütet. Die beiden Häftlinge Pippig und Höfel staunen nicht schlecht, als sie im Koffer ein Kind entdecken. Nachdem das Kind mehrere Tage im Lager versteckt wird – unter erhebliche Gefahren und Gefährdung der Aktivitäten der illegalen Widerstandsgruppe – wird schweren Herzens entschieden, den Polen mit dem Kind ins Vernichtungslager zu schicken. Walter Krämer, der Lagerälteste, widersetzt sich der Entscheidung und nimmt das Kind in seine Obhut. Mit der Hilfe mutiger und einfallsreicher Helfer stellt er sich der gefährlichen Aufgabe das Kind vor der SS zu retten und mit Menschlichkeit der menschenfeindlichen Umgebung zu trotzen.

„Nackt unter Wölfen“ ist die Neuverfilmung des bekannten, gleichnamigen DDR-Romans von Bruno Apitz. Der Fokus liegt auf den letzten Tagen des 2. Weltkrieges und die Befreiung des KZ Buchenwald. „Nackt unter Wölfen“ stellt das Nachfolgeprojekt der Macher von „Unsere Mütter, unsere Väter“ dar.